طحن البكتين عمليةٌ تُحوّل البكتين، وهي مادة طبيعية موجودة في الفواكه والخضراوات، إلى مسحوق ناعم. تتضمن هذه العملية طحن أو سحق المادة الغنية بالبكتين، مما يُقلل من حجم جزيئاتها ويزيد من مساحة سطحها، فيسهل استخلاصها واستخدامها في المنتجات الغذائية والصيدلانية. يُعدّ طحن البكتين ضروريًا لصنع المربى والهلام، حيث يحتاجان إلى عامل مُكثّف أو مُجلّد. كما يُستخدم أيضًا في صناعة الأدوية ذات الإطلاق المُتحكّم به والمكملات الغذائية. يُعزّز طحن البكتين من فوائده في العديد من التطبيقات.